Сегодня система экологического мониторинга включает в себя более десяти подсистем, среди которых мониторинг атмосферного воздуха, выбросов промышленных предприятий, водных объектов, дна, берегов, водоохранных зон, почв, опасных геоэкологических процессов, зеленых насаждений, уровней шума. Также в систему экологического мониторинга Москвы входит одна из крупнейших в РФ аналитических лабораторий.

 В лаборатории реализованы все современные методы исследования, такие как спектральные методы (фотометрия, атомная абсорбция, спектрометрия с плазмами), хроматографические (газовая и высокоэффективная жидкостная хроматографии). Проводятся количественные определения летучих органических соединений, полиароматических углеводородов, газов, пыли мелкодисперсных фракций.

Лаборатория оснащена не только высокоточным современным оборудованием, но и располагает уникальным оборудованием для гравиметрических исследований концентраций взвешенных частиц. В 2014 года в лаборатории введена в эксплуатацию автоматическая взвешивающая система для анализа пыли гравиметрическим методом. Гравиметрический метод является эталонным, то есть служит ориентиром для верификации измерений другими методами.

В своей практике сотрудники лаборатории применяют более 150 единиц специализированного оборудования, в том числе порядка 20 единиц сложных аналитических приборов, таких как газовые и жидкостные хроматографы, хромато-массспектрометры, спектрометры с индуктивно связанной плазмой и другие. В область аккредитации Аналитической инспекции внесено более 300 методик выполнения количественного химического анализа для различных объектов. Годовой объём проводимых исследований превышает 200 тысяч элементоопределений.

Лаборатория также решает задачи исследовательского уровня по поиску неизвестных веществ в природных средах и других объектах. Это сложная и кропотливая работа, которая требует коллективного подхода к решению задачи. После отбора пробы проводят её комплексное исследования различными методами, затем полученные данные анализируют и, опираясь на литературные данные, выносится суждение о наличии того или иного редкого загрязнителя или просто вещества, которое редко встречается как вещество-загрязнитель.

Отдельным направлением деятельности лаборатории является аналитическое сопровождение государственного экологического надзора.

Специалисты лаборатории привлекаются органами прокуратуры и государственными экологическими инспекторами для отбора проб и проведения исследований промышленных выбросов, сточных вод, отходов, почвогрунтов.

В целом, аналитическая лаборатория обеспечивает аналитические исследования под статьи главы 8 КоАП РФ — административные правонарушения в области охраны окружающей среды и природопользования

В конце 2011 года — 2012 года произведено масштабное обновление приборного парка Аналитической лаборатории. Закуплено и введено в эксплуатацию более 15 единиц прецизионного оборудования.  Парк оборудования регулярно обновляется, старые приборы меняются на современные. Связано это, в том числе, и с высокой загруженностью оборудования (что приводит к быстрому износу), а также с появлением новых требований к проведению исследований. С 2012 года в два раза увеличилось количество выполненных элементоопределений состояния компонентов природной среды.

В штате лаборатории у всех сотрудников высшее образование, пятеро имеют ученую степень. Сотрудники на регулярной основе повышают свою квалификацию путем внешнего обучения и самообразования по различным направлениям деятельности лаборатории.